Среди них можно отметить бесцветные серобактерии, некоторые виды железобактерий, нитрификаторы, фототрофные бактерии — вся эта флора с окислительным типом обмена. Кроме того, можно отметить и водные грибы, которые здесь полифункциональны и участвуют в разложении органических остатков, паразитируют на растениях и животных, участвуют в симбиотрофных ассоциациях водорослей и прокариот, усложняя этим самым биогидроценозы. Наиболее характерными представителями водных грибов являются виды родов тетракладиум, сапролегния, трипоспермум, хитридиум и др. В конце подобного микробного факела численность сапробных микробов многие десятки миллионов. Это так называемый мезосапробный уровень. Здесь обычно богатая кислородом речная вода теряет его, обогащаясь углекислотой, метаном и даже сероводородом.

Естественно, что все оксифильные реобионты здесь моментально погибают, а фильтрационный комплекс биологического самоочищения вод глубоко разрушается. Сохраняются и даже повышают свою численность лишь некоторые бактериоядные инфузории, например, родов Chilodonella,
Paramaecium, Urocentrum и др., а также питающиеся путем впитывания органики прямо через покровы бесцветные жгутиковые из зоофлягеллят. Только в мезосапробной зоне, положение которой зависит от набора загрязнителей и скорости течения реки, где число бактерий не превышает 20 — 30 млн/мл появляются коловратки, планктонные рачки, и. что особо важно, водоросли, начинающие снижать пресс бескислородности.